Trên cơ sở quan hệ tốt đẹp giữa hai nước, hợp tác thực thi pháp luật giữa Bộ Công an Việt Nam và các cơ quan thực thi pháp luật Nhật Bản như: Cơ quan Cảnh sát quốc gia, Bộ Nội vụ và Truyền thông, Bộ Tư pháp…luôn được duy trì và đạt nhiều kết quả tích cực, thực chất.