Bên cạnh việc tổ chức cho hàng vạn cán bộ, chiến sĩ, học sinh miền Nam tập kết ra Bắc đúng tinh thần Hiệp định Genève, nhận định về khả năng địch phá hoại Hiệp định, thượng tuần 9/1954, Bộ Chính trị đã ban hành thêm chỉ thị về tình hình, nhiệm vụ và chính sách mới, vạch rõ: “Nhiệm vụ của Đảng ở miền Nam trong giai đoạn hiện tại là lãnh đạo đấu tranh thực hiện Hiệp định đình chiến, đồng thời phải lãnh đạo nhân dân chống những hành động khủng bố, đàn áp, phá cơ sở của ta, bắt bớ cán bộ ta và quần chúng cách mạng, tấn công của địch, giữ lấy quyền lợi quần chúng giành được trong thời kỳ kháng chiến, nhất là ở những căn cứ địa và vùng du kích của ta”.
