Như vậy, VQG Côn Đảo là khu Ramsar thứ 6 (sau VQG Tràm Chim (Đồng Tháp), VQG Mũi Cà Mau, VQG Xuân Thủy (Nam Định), vùng ngập nước Bàu Sấu (Đồng Nai), VQG Ba Bể) và là khu Ramsar biển đầu tiên của Việt Nam.
Vườn quốc gia Côn Đảo có hệ sinh thái biển rất đa dạng, phong phú với 1.321 loài sinh vật biển, trong đó thực vật ngập mặn có đến 23 loài, rong biển 127 loài, cỏ biển 7 loài, san hô 219 loài, thú và bò sát biển 5 loài...
Nơi đây cũng có tới 37 loài được ghi trong Sách đỏ Việt Nam. Đặc biệt, Côn Đảo còn là bãi đẻ trứng của một số loài rùa biển
