Việc ký hợp đồng chuyển nhượng quyền thu phí trên tuyến cao tốc này nhằm mục đích nhanh chóng hoàn trả lại vốn ngân sách đã đầu tư xây dựng tuyến. Thông qua qua đấu giá công khai, Công ty Yên Khánh đã được Bộ GTVT chọn trúng đấu giá quyền thu phí với số tiền hơn 2.004 tỷ đồng trong thời hạn 5 năm, bắt đầu từ ngày 1/1/2014. Dù tuyến cao tốc trên đã được đưa vào khai thác từ đầu tháng 2/2010 và thực hiện thu phí hoàn vốn đã bỏ ra đầu tư cho ngân sách từ cuối tháng 2/2012, nhưng quá trình hoàn vốn khá chậm
