Theo Bộ trưởng GTVT Đinh La Thăng, việc một số báo đưa công văn có có nội dung yêu cầu Ban Quản lý dự án 3 xử lý theo chỉ đạo của lãnh đạo Bộ là không đúng sự thật và Bộ GTVT đã có văn bản đề nghị Tổng cục Cảnh sát (Bộ Công an) xem xét điều tra để xử lý đúng pháp luật.