Với vai trò là người đứng đầu Bênh viện Thủ Đức, cũng là người có vai trò cầm đầu vụ án, Nguyễn Minh Quân là người chịu trách nhiệm chính trong vụ án liên quan đến việc đầu thầu sau quy định. Quân đã cố tình thành lập các công ty “sân sau” rồi “đạo diễn” để các công ty của mình trúng 27/28 gói thầu, với tổng giá trị hơn 345,2 tỷ đồng, chiếm đoạt hơn 100 tỷ đồng.