Năm 2016, tập thể C46 được Nhà nước tặng thưởng Huân chương Quân công hạng Nhất; 176 lượt tập thể, cá nhân của đơn vị được Nhà nước, Chính phủ, Bộ Công an, Tổng cục Cảnh sát và các Bộ, ngành tặng Bằng khen, Giấy khen các loại. 6 đồng chí là Chiến sỹ thi đua toàn ngành.