Những năm đầu Bệnh viện Đa khoa TP Đông Hà đi vào hoạt động, bệnh nhân đến khám chữa bệnh ít, rác thải y tế theo đó phải xử lý thấp nên ít ảnh hưởng ra môi trường. Tuy nhiên, những năm sau đó bệnh nhân đông, rác thải y tế lớn nên mức độ ô nhiễm môi trường trở nên trầm trọng.