Theo sử liệu vào năm 1618, thời vua Lê Kính Tông, niên hiệu Hoàng Định 18, chùa Phổ Linh được Thiền sư Minh Tạng cùng dân làng vùng Nghi Tàm - Quảng Bá (Quận Tây Hồ) …trùng tu.
Ngôi chùa nằm gần bờ hồ Tây với gian chính điện thờ Mẫu được xem là đẹp bậc nhất tại Hà Nội. 
Nội thất như cửa, xà ngang đều làm bằng gỗ lim rất chắc chắn.
Gian thờ chính của chùa có rất nhiều phần được chạm khắc tinh vi.
Thủy đình của chùa được dựng giữa một hồ sen bên trong thờ Phật bà nghìn mắt nghìn tay.
Không chỉ thu hút Phật tử nhờ thiết kế uy nghi đẹp mắt, chùa Phổ Linh còn là ngôi thiền tự duy nhất ở Hà Nội có hẳn một động thờ thai nhi.
Phải mất hai tháng xây dựng động mới hoàn thành. Động cao hơn 2m, rộng 2,8 và có lòng động sâu hơn 90cm.
Giữa động được tôn trí tượng Phật A Di Đà cao 30cm, bằng gỗ, phía dưới tượng Phật là ban thờ có di ảnh của một bé nam và một bé nữ.
Xung quanh khuôn viên động có rất nhiều hình tượng các cô bé, cậu bé… bằng gỗ. Sư cô Thích Đàm Chung cho biết, muốn giành một góc trong khuôn viên chùa để thờ cúng các thai nhi – vốn là những vong hồn không được các bậc làm cha làm mẹ quan tâm thờ cúng.
Hiện trong tất cả các ngôi chùa ở Hà Nội, chỉ duy nhất chùa Phổ Linh là có “Động thờ thai nhi”.
Nhóm PV